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バイオインフォマティクス講座
バイオインフォマティクス講座の一部が視聴できます。まずは無料動画を見て、分かりやすさやレベル感を確認してみてください。
無料トライアル版に含まれる内容（約1時間相当）
- はじめに
- 第3章 教師あり学習の発展的話題
トライアルを利用せずに講座にお申込みの方はこちら
講座で得られる知識・スキル
- Pythonによる RNA-Seq 解析、シングルセル解析の実装方法
- ImageJ の利用方法とマクロを使った自動化の実現方法
- バイオインフォマティクス分野における活用事例の知識
受講に必要なスキル・前提知識
必須スキル
- 生物学・生命科学の基礎知識
- 機械学習に必要な数学の基礎知識 (機械学習・ディープラーニングのための基礎数学講座 修了相当)
- Pythonプログラミングの基礎知識 (機械学習のためのPython入門講座 修了相当)
- 機械学習アルゴリズムの基礎知識＋実装経験 (現場で使える機械学習・データ分析基礎講座 修了相当)
推奨スキル
- ディープラーニングの基礎知識(現場で使えるディープラーニング基礎講座 修了相当)
講座の特長
- ライフサイエンスに強みを持つライフマティックス株式会社が監修
- RNA-Seq 解析・シングルセル解析の主要なアルゴリズムとその実装方法が学べる
- 画像解析に重要な ImageJ の利用方法や機械学習を使った方法が学べる
こんな方におすすめ
- 生命科学データに対して機械学習を適用したいと考えている方
- 機械学習を使ったバイオインフォマティクスに興味があると考えている方
- 医療・ヘルスケア業界におけるデータ分析を行いたいと考えている方
ライフマティックス株式会社とは
ライフマティックス株式会社は、「ライフサイエンスに関する企業を支援することで、世の中に貢献する」ことをミッションに掲げ、高度な情報技術によりライフサイエンス分野の推進に貢献しています。
「ソフトウェア開発」、「研究業務の支援」、「データ解析」、「計算環境の整備」を主たるサービスとして提供しています。情報システムの専門家とライフサイエンスの専門家が多く所属しており、迅速かつ的確にお客様のビジネスを支援しています。
カリキュラム（一部抜粋）
教師あり学習の基礎
- 機械学習の全体像と教師あり機械学習
- 教師あり機械学習における評価指標
など全4トピックス
教師あり学習の代表的なモデル
- 線形回帰
- ロジスティック回帰
など全7トピックス
教師あり学習の発展的話題
- 説明可能なAI (Explainable AI, XAI) とは？
- SHAP (Shapley Additive exPlanations)
- CAM(Class Activation Map)
など全4トピックス
教師なし学習の代表的なモデル
- 主成分分析(PCA)
- t-SNE(t分布型確率的近傍埋め込み法)
など全5トピックス
- はじめに
- 第1章 ⽣命データの基礎と関連事例
- 第2章 RNA-Seq解析
- 第3章 シングルセル解析
- 第4章 画像処理
- 第5章 バイオインフォマティクスに必要な計算環境
※カリキュラムは変更となる場合がございます。
開催日程
講師紹介
-
スキルアップAI講師。横浜国立大学大学院 環境情報学府 情報メディア環境学専攻（現:情報環境専攻）修了。修士（情報学）。高専時代に画像認識に対して興味を持ったことがきっかけで、現在はDeep Learningや機械学習、進化計算などの人工知能分野におけるアルゴリズムの研究開発やコンサルティングに従事。日本ディープラーニング協会の2018年度・2019年度E資格合格者、2018年度G検定合格者。
ご案内
PCの動作環境
- MacOSX 10.9 以上（教材として提供するNotebookの一部に、M1 MacまたはM2 Macに対応していないものがあります。詳細はお問い合わせください。）
- Windows 8 以上（64bit必須）
- メモリ8GB以上必須
※8GB未満でも受講して頂くことは可能ですが、大容量のデータを扱うため、より高スペックなPCの利用を推奨しています。
メモリ不足が原因の不具合についてはサポートすることができませんので、あらかじめご了承ください。
事前準備
本講座では、MinicondaまたはAnacondaと画像処理ソフトウェア ImageJ Fiji をインストールしていただきます。また、pipというライブラリ管理ソフトを使って、Python ライブラリをインストールしていただきます。これらインストール作業を行えるパソコン環境をご準備ください。特に、社用のパソコンなどでアクセス制限のあるインターネット回線をご利用の方は、インストール作業を問題なく行えることを事前にご確認ください。ご不明な点がございましたら、事前にご連絡ください。
